Собрание музея образуют: основной фонд, научно-вспомогательный фонд, фонд сырьевых материалов, экспериментальный фонд, фонд массовых археологических предметов, иные фонды.
Музейные предметы, документирующие развитие природы и историю развития естественно-научных дисциплин: образцы природы, уникальные объекты живой и неживой природы, сборы крупнейших естествоиспытателей, имеющие научное или мемориальное значение, образцы техники, подлинные изобразительные материалы, характеризующие природные условия, письменные, изобразительные, вещественные памятники, отражающие историю естественных наук.
Музейные предметы, документирующие историю и развитие человеческого общества: вещественные памятники, археологические предметы, музейные предметы, являющиеся свидетельством экономических процессов, общественных отношений, внутренней и внешней политики, истории и уровня развития культуры (в том числе орудия труда, образцы продукции, оружие, знамена, обмундирование, предметы быта и одежды, включая произведения профессионального декоративно-прикладного искусства и народного творчества), мемориальные предметы, связанные с историческими событиями или выдающимися личностями (деятелями науки, культуры, искусства, общественными деятелями);нумизматические и сфрагистические материалы, предметы фалеристики и геральдики; произведения изобразительного и декоративно-прикладного искусства (живопись, скульптура, графика, в том числе плакаты), имеющие документальное, мемориальное или художественное значение; фотографические материалы (фотографии, фотоотпечатки), имеющие документальное, мемориальное или художественное значение; карты, атласы, глобусы, планы, чертежи, связанные с историческими событиями и явлениями, историей науки, географическими открытиями и подобными историческими событиями; письменные памятники - рукописные и печатные документы; книги рукописные, старопечатные, с автографами, редкие издания; киноматериалы - документальные и художественные; фонозаписи речевые и музыкальные, имеющие документальное, мемориальное или художественное значение.
Музейные предметы, документирующие историю развития техники: вещественные памятники (в том числе машины, механизмы, приборы); произведения изобразительного искусства, чертежи и фотографии, отражающие жизнь и деятельность ученых, изобретателей, отдельные технические процессы и другие свидетельства технического прогресса); письменные памятники (техническая документация, документы, связанные с жизнью и деятельностью ученых, изобретателей и других выдающихся деятелей в сфере развития науки и техники); фонозаписи и кинофильмы, отражающие этапы развития техники.
Мемориальные предметы: предметы, принадлежавшие исторической личности или его ближайшему окружению (вещественные, изобразительные, письменные памятники, кинофотофонодокументы); предметы, относящиеся к памятному событию (вещественные, изобразительные, письменные памятники, фонодокументы); памятники, не являющиеся мемориальными, но отражающие историческую обстановку, относящиеся ко времени жизни известной личности или памятному событию, а также результаты деятельности исторической личности, судьбу творчества в последующие эпохи; произведения литературы и искусства, посвященные меморируемому лицу или событию.
К научно-вспомогательному фонду относятся музейные предметы: воспроизведения (фотокопии, слепки, муляжи, макеты), реконструкции, карты, диаграммы, схемы, планы и другие предметы, разработанные или приобретенные в процессе комплектования, изучения и экспонирования музейных коллекций; образцы сельскохозяйственных культур и других натуральных материалов, подверженных порче и требующих частой замены; натуральные материалы - объекты природы, не имеющие музейного значения, но используемые для наглядного показа некоторых особенностей природы и ее явлений.
В состав фонда сырьевых материалов входят музейные предметы, являющиеся законсервированными и снабженными описями предметами (объектами) неорганической и органической природы, предназначенные для аналитических лабораторных исследований и препарирования: шкурки, тушки, энтомологические сборы, засушенные растения для монтажа гербария, неотпрепарированные палеонтологические, геологические, минералогические образцы, фрагменты материалов (дерева, угля, металла и другое), полученные при археологических раскопках, а также образцы натуральных предметов, подверженных порче и требующих частой замены.
В музейный фонд университета в 2024 г. поступили следующие предметы.
Плуг-окучник конный однокорпусный первой половины 20 в. Рабочая часть (корпус) состоит из лемеха, отвала и полевой дощечки. Корпус плуга прикреплен к раме(грядиль). Служебная часть состоит из бороздового колеса и рычагов управления. Бороздовое колесо подвижно закреплено в металлическую планку, которая болтами крепится перед плугом к раме. В передней части рамы расположено сквозное отверстие. Детали корпуса и рычаги плуга припаяны к раме.
2. Этажерка 1940-1950-е гг. СССР. Изготовлена из дерева и покрыта лаком. Представляет собой две узкие (вверху) и три широкие (внизу) прямоугольные полочки, соединенные по углам точеными столбиками. Столбики, соединяющие верхние полочки, наверху заканчиваются шарообразным декоративным элементом.
Булавы Т.И. Бородкиной. В 1952 г. кафедрой физкультуры стала заведовать известный в городе спортсмен Татьяна Ивановна Бородкина. Студенты института регулярно занимали первые места по легкой атлетике и лыжным гонкам.
4. Стол середины 1950-1960-х гг. из корпуса № 2 АСХИ и печатная машинка 1957 г.
5. Перила лестницы парадного входа корпуса № 2 АСХИ (Горного госпиталя второй половины ХIХ постройки). Кованые перила эпохи классицизма украшены виноградной лозой, венками, розетками, изогнутыми листьями. В стиле модерн отсутствуют прямые линии, делается упор на абстрактный орнамент, ассиметричность рисунка. Кузнецы охотнее использую изгибы и завитки. Кое-где просматриваются восточные мотивы.
6. Наградной кубок студенческого строительного отряда Алтайского сельскохозяйственного института «Колос»
7. Медаль «За освоение целинных земель»
8.Значок
трактор «ДТ-54» и табличка от трактора
ДТ-75. В годы освоения целинных и залежных
земель на полях Алтайского края начали
работать тысячи тракторов. Ремонт
тракторов и подготовка их к работе
обеспечивалась преподавателями и
студентами Алтайского сельскохозяйственного
института. Об этом рассказывают нам эти
музейные предметы.
9. Вывеска «Молодость» и проигрыватель. В Алтайском сельскохозяйственном институте действовали клуб «Молодость», где студенты готовили театрализованные представления, и кафе «Молодость», где проходили дискотеки.
Музей истории выражает благодарность самым активным дарителям: Н.С. Шаламову, А.А. Смышляеву, А.А. Кокшарову, В.Д. Томчуку, В.А. Никоновой.